复旦大学附属金山医院普外科是医院重点建设专科，目前拥有病床数94张，科室人才梯队完整，现有医生25名，其中主任医师2名（其中硕士生导师1名），副主任医师10名，主治医师8名，住院医师5名。具有博士学位者2名、硕士学位者19名。
普外科病房共有两个病区（三病区和八病区），拥有超声刀、腹腔镜（3D腹腔镜）、胆道镜、乳腺导管内窥镜、麦默通微创旋切系统、便携式B超机等先进仪器设备。每年门诊量50000余人次，年住院患者4000余人次，年住院手术3000余例。
科室下设胃肠疝、肝胆胰脾、甲状腺乳腺三个亚专业组。亚专业组业务特色包括：（1）肝脏、胆囊、胆管、胰腺、脾脏良恶性疾病的开腹/腹腔镜手术；（2）胆道结石的微创治疗（胆道镜、ERCP），胆道镜、腹腔镜双镜联合手术；（3）胃肠道恶性肿瘤的腹腔镜手术及多学科综合治疗；（4）乳腺导管内窥镜检查，乳腺结节麦默通微创旋切手术；（5）乳腺癌的早期诊断与治疗；（6）内镜辅助小切口甲状腺手术；（7）腹股沟疝、腹壁切口疝的腹腔镜手术；（8）内镜逆行阑尾炎治疗术（ERAT）等。近年大力推动肝胆胰肿瘤、胃肠肿瘤、乳腺肿瘤的多学科MDT建设；推动微创外科技术在甲状腺乳腺疾病中的应用。

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